RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560099.5

PSMA4-218, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene PSMA4, Length 2,596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-218ENST00000560099 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 RTP4Q96DX8 246 aa21.38■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.38■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 COPEO14579 308 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 P4HA1P13674 534 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 INSRRP14616 1297 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ZBED1O96006 694 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 MYL2P10916 166 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ABL2P42684 1182 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 PHKA2P46019 1235 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 SLC26A2P50443 739 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 FAM187BQ17R55 369 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 CES4AQ5XG92 561 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 NSL1Q96IY1 281 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 DONSONQ9NYP3 566 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 LRRC42Q9Y546 428 aa21.37■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 APOL1O14791 398 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 CCDC22O60826 627 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 DNAJC6O75061 913 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 VTNP04004 478 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 TNFAIP2Q03169 654 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ZBTB16Q05516 673 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 CBLBQ13191 982 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 BMPR2Q13873 1038 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 PDK2Q15119 407 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 SLC9A4Q6AI14 798 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 OLFML1Q6UWY5 402 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 MAGEB5Q9BZ81 275 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 BATF3Q9NR55 127 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 DPP3Q9NY33 737 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 OTOFQ9HC10 1997 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 GSC2O15499 205 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 GABBR2O75899 941 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 BOLA3Q53S33 107 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 TTC30AQ86WT1 665 aa21.36■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 RFPL1O75677 317 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 OSBPP22059 807 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 RINLQ6ZS11 566 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 OTUD5Q96G74 571 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 SLC13A1Q9BZW2 595 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 PLLPQ9Y342 182 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 CYB561D2O14569 222 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 TGM2P21980 687 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 PRKCHP24723 683 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 BAG6P46379 1132 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ELP3Q9H9T3 547 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ARMCX1Q9P291 453 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 AKT3Q9Y243 479 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 NME7Q9Y5B8 376 aa21.35■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 METTL18O95568 372 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 CSH1P0DML2 217 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 CSH2P0DML3 217 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 UNC5AQ6ZN44 842 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ZNF534Q76KX8 674 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 MPP5Q8N3R9 675 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ARMC2Q8NEN0 867 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 KLC2Q9H0B6 622 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 ERAP1Q9NZ08 941 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 CSADQ9Y600 493 aa21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
PSMA4-218ENST00000560099 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms