RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 IQCDQ96DY2 449 aa19.8■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM62Q9BVG3 475 aa19.8■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 NUP58Q9BVL2 599 aa19.8■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 YJEFN3A6XGL0 299 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 E7ENQ6 273 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ARNTLO00327 626 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 FERP16591 822 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 PBX1P40424 430 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ZXDBP98169 803 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CDR2Q01850 454 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ARID5AQ03989 594 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM110Q86TL2 294 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 SIX5Q8N196 739 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 RIN3Q8TB24 985 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 BAP1Q92560 729 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ZFYVE19Q96K21 471 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CPXM1Q96SM3 734 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 EDEM3Q9BZQ6 932 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 TTYH3Q9C0H2 523 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 MIS12Q9H081 205 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCC13Q9NSE7 274 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CFAP97Q9P2B7 532 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CA14Q9ULX7 337 aa19.79■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 TBX18O95935 607 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 LTFP02788 710 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 MMEP08473 750 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 IFNAR2P48551 515 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 PDGFRLQ15198 375 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 BSPRYQ5W0U4 402 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM72Q6ZMU5 477 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 SCUBE3Q8IX30 993 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 WDTC1Q8N5D0 677 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 MSANTD4Q8NCY6 345 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 CLEC4CQ8WTT0 213 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC20A1Q8WUM9 679 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 OSCP1Q8WVF1 389 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM83CQ9BQN1 747 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 MFSD1Q9H3U5 465 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 SYNCQ9H7C4 482 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 C11orf16Q9NQ32 467 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 NUDT5Q9UKK9 219 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 STRIP2Q9ULQ0 834 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF318Q5VUA4 2279 aa19.78■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ITIH6Q6UXX5 1313 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 E2F8A0AVK6 867 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM86C2PA6NEL3 165 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 LRRC53A6NM62 1247 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 GPR37L1O60883 481 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 PRKCQQ04759 706 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 PTPN20Q4JDL3 420 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM31Q5JXX7 168 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 MIB1Q86YT6 1006 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF139Q8WU17 664 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP2A3Q93084 1043 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM149B1Q96BN6 582 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 SHDQ96IW2 340 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 HEBP1Q9NRV9 189 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 GKN1Q9NS71 199 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 MARCH2Q9P0N8 246 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 RASAL2Q9UJF2 1139 aa19.77■□□□□ 0.76
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A1W2PQJ5 194 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 KRBA1A5PL33 1030 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 PRR33A8MZF0 331 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 MDM4O15151 490 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 IRF1P10914 325 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 NOMO3P69849 1222 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 FMO1Q01740 532 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 EFEMP1Q12805 493 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC44A4Q53GD3 710 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 HFE2Q6ZVN8 426 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 EDEM1Q92611 657 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 PBXIP1Q96AQ6 731 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 MSANTD3Q96H12 275 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 EBF3Q9H4W6 596 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D14Q9P2M4 693 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 WNT6Q9Y6F9 365 aa19.76■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 ERBB2P04626 1255 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 GLULP15104 373 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 COG7P83436 770 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 TNK2Q07912 1038 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 ASIC2Q16515 512 aa19.75■□□□□ 0.75
RABGGTA-208ENST00000558954 SFMBT2Q5VUG0 894 aa19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms