RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, human

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FOXN3-210	ENST00000555658	AK8	Q96MA6	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	IWS1	Q96ST2	819 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658		A0A1B0GVL5	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	PLD2	O14939	933 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	GAS7	O60861	476 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	STAM2	O75886	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TDP2	O95551	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68	4e-12	■■□□□ 13
FOXN3-210	ENST00000555658	PFKFB1	P16118	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	HK1	P19367	917 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CCND2	P30279	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	MAPK4	P31152	587 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TEC	P42680	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TM4SF4	P48230	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	NDUFA8	P51970	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	UBXN2A	P68543	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	ADAM8	P78325	824 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	GRM1	Q13255	1194 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	EPHA7	Q15375	998 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	STXBP2	Q15833	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	ERMN	Q8TAM6	284 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	RIT2	Q99578	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	ASB14	A6NK59	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	MSH4	O15457	936 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	MTSS1	O43312	755 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CA12	O43570	354 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	B3GALT2	O43825	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	SLC37A4	O43826	429 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	TLR2	O60603	784 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CNMD	O75829	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	SMC2	O95347	1197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	ASL	P04424	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	LMO1	P25800	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	AMPD3	Q01432	767 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	MTMR1	Q13613	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	PGM5	Q15124	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	IL17A	Q16552	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	CAMK4	Q16566	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FOXN3-210	ENST00000555658	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms