RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555209.5

RBM23-215, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RBM23, Length 2,278 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-215	ENST00000555209	HSFY1	Q96LI6	401 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	GMNC	A6NCL1	334 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	DNM1L	O00429	736 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	DPYSL4	O14531	572 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	RIPK2	O43353	540 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	NPR3	P17342	541 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	LHX1	P48742	406 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	RAB27A	P51159	221 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	GDF10	P55107	478 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	DPYSL3	Q14195	570 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	CRYM	Q14894	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	TAZ	Q16635	292 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	LHX8	Q68G74	356 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	PGBD4	Q96DM1	585 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	SGSM3	Q96HU1	749 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	KCNK16	Q96T55	309 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	ACSL3	O95573	720 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	ITGAV	P06756	1048 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	YY1	P25490	414 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	VEGFB	P49765	207 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	CAV1	Q03135	178 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	FAM26D	Q5JW98	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	DEFB106A	Q8N104	65 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	SPATA18	Q8TC71	538 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209		A0A1W2PQY0	241 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209		F8W810	466 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	TRAPPC3	O43617	180 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	CAND2	O75155	1236 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	AP1G2	O75843	785 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	ENDOD1	O94919	500 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	FAM200B	P0CF97	657 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	APLP1	P51693	650 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	NRL	P54845	237 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	KYNU	Q16719	465 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	DCAF6	Q58WW2	860 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	RNF157	Q96PX1	679 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	TBCB	Q99426	244 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	C5orf60	A6NFR6	353 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	APOC2	P02655	101 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM23-215	ENST00000555209	NUDT17	P0C025	328 aa		11.16	□□□□□ -0.62

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