RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NRP1	O14786	923 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RECQL4	O94761	1208 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF202	O95125	648 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	EDN1	P05305	212 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PFKFB1	P16118	471 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CMA1	P23946	247 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC11A1	P49279	550 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ACOT2	P49753	483 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NDUFA8	P51970	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	STARD6	P59095	220 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ADCY1	Q08828	1119 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MTAP	Q13126	283 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MAPK7	Q13164	816 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CUL4B	Q13620	913 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM187B	Q17R55	369 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ISM2	Q6H9L7	571 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	C12orf40	Q86WS4	652 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	VPS52	Q8N1B4	723 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	HASPIN	Q8TF76	798 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TCEAL3	Q969E4	200 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC51	Q96ER9	411 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	BORCS6	Q96GS4	357 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PAGE5	Q96GU1	130 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC120	Q96HB5	630 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MYADM	Q96S97	322 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LACTBL1	A8MY62	500 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TISP43	B9A030	160 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994		I3L4J1	428 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CLIC2	O15247	247 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TOM1L1	O75674	476 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GALT	P07902	379 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SPATA31D3	P0C874	917 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MCF2	P10911	925 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TDGF1	P13385	188 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	KLRC2	P26717	231 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PPM1A	P35813	382 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TNFSF9	P41273	254 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	FNTB	P49356	437 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NCKAP1L	P55160	1127 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ARPP19	P56211	112 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GPC5	P78333	572 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	POSTN	Q15063	836 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GPR149	Q86SP6	731 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GGN	Q86UU5	652 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PALB2	Q86YC2	1186 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MFSD4A	Q8N468	514 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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