RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552437.1

HECTD4-214, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 3

Gene HECTD4, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-214	ENST00000552437	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	PJA1	Q8NG27	643 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	HSFY1	Q96LI6	401 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	MIS12	Q9H081	205 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.95	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	MAN2B1	O00754	1011 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CTH	P32929	405 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	EFEMP1	Q12805	493 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	MEA1	Q16626	185 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	TAF3	Q5VWG9	929 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	FAM3C	Q92520	227 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	EDEM1	Q92611	657 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	E2F8	A0AVK6	867 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	FAM170A	A1A519	330 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437		E5RJQ4	531 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	GFPT2	O94808	682 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	GLUL	P15104	373 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CYP11B1	P15538	503 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	KRT9	P35527	623 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	JAM2	P57087	298 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	BPIFB4	P59827	614 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	PDCL	Q13371	301 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	SCML4	Q8N228	414 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	STK32A	Q8WU08	396 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	SPAG5	Q96R06	1193 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		11.93	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437		A0A1B0GTH6	734 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	GREM1	O60565	184 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	FBXO21	O94952	628 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	NFATC1	O95644	943 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CAVIN2	O95810	425 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	SERPINC1	P01008	464 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	LTF	P02788	710 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	CYP17A1	P05093	508 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	HMBS	P08397	361 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	GJA4	P35212	333 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	SOX5	P35711	763 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	ACADSB	P45954	432 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	TPM4	P67936	248 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	PON2	Q15165	354 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	TMEM110	Q86TL2	294 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	ZNF276	Q8N554	614 aa		11.92	□□□□□ -0.5
HECTD4-214	ENST00000552437	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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