RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PSMD6	Q15008	389 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SPATA1	Q5VX52	437 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CEP135	Q66GS9	1140 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	MIB1	Q86YT6	1006 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ANO10	Q9NW15	660 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	DACH1	Q9UI36	760 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PIR	O00625	290 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ALDH1A2	O94788	518 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CYP3A5	P20815	502 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	TYRO3	Q06418	890 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SURF1	Q15526	300 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CCDC157	Q569K6	752 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ZNF843	Q8N446	348 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SCN1A	P35498	2009 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PTPRJ	Q12913	1337 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	KAT7	O95251	611 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CYP11A1	P05108	521 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	USP17L7	P0C7H9	530 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	14.67	□□□□□ -0.06	8e-9	■■■■□ 26.7
CS-231	ENST00000552222	CLDN10	P78369	228 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ENPEP	Q07075	957 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	STX1A	Q16623	288 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	NAT16	Q8N8M0	369 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	TMC2	Q8TDI7	906 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CEP63	Q96MT8	703 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ACOX2	Q99424	681 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ANO9	A1A5B4	782 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SYCE3	A1L190	88 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	LEFTY2	O00292	366 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	KRT10	P13645	584 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	HDC	P19113	662 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	USP46	P62068	366 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	GRIK2	Q13002	908 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CAMK2B	Q13554	666 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	DHCR24	Q15392	516 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	ZNF605	Q86T29	641 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	WDR49	Q8IV35	697 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	CGRRF1	Q99675	332 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	RNF38	Q9H0F5	515 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	INTS13	Q9NVM9	706 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	KALRN	O60229	2985 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222		A0A087WV48	116 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	AP5Z1	O43299	807 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	NOL4	O94818	638 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	VAMP7	P51809	220 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	DLG4	P78352	724 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	BNC1	Q01954	994 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	NR1H3	Q13133	447 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	PCSK4	Q6UW60	755 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CS-231	ENST00000552222	OSTM1	Q86WC4	334 aa		14.65	□□□□□ -0.06

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