RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 IDEP14735 1019 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ATF2P15336 505 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 BMP7P18075 431 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 SMARCA1P28370 1054 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 GNA11P29992 359 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ECHS1P30084 290 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 MCM7P33993 719 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ARHGAP25P42331 645 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 PRCPP42785 496 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 KCNQ1P51787 676 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 CDR1P51861 262 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 MAP2K6P52564 334 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 VAV2P52735 878 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 EPHB4P54760 987 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 LINC00310P59036 64 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 GSTO1P78417 241 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 GPSM2P81274 684 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 POU5F1BQ06416 359 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 CHRNDQ07001 517 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 TROAPQ12815 778 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 SEMA5AQ13591 1074 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 FGL2Q14314 439 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 KRT72Q14CN4 511 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 SEPT2Q15019 361 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 HLFQ16534 295 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 TMEM266Q2M3C6 531 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 XRRA1Q6P2D8 792 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 RTKN2Q8IZC4 609 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 MMGT1Q8N4V1 131 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 KYQ8NBH2 561 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 CCDC138Q96M89 665 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ERGIC2Q96RQ1 377 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 PNKPQ96T60 521 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 TBCBQ99426 244 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 TSG101Q99816 390 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 GORASP1Q9BQQ3 440 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ANKRD2Q9GZV1 360 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 EPB41L4BQ9H329 900 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 C6orf50Q9HD87 102 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 JADE2Q9NQC1 790 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 TMEM51Q9NW97 253 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 LUZP4Q9P127 313 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 HPCAL4Q9UM19 191 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 DMTF1Q9Y222 760 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 HYOU1Q9Y4L1 999 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 BCL9O00512 1426 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 RREB1Q92766 1687 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 XDHP47989 1333 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 DUOX1Q9NRD9 1551 aa4.7□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 DLEC1Q9Y238 1755 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 GRID2IPA4D2P6 1211 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 GOLGA6L10A6NI86 522 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 MAFO75444 373 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 KIAA0754O94854 1291 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 PLEKHA8P1O95397 391 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 LY86O95711 162 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 BAG3O95817 575 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 GNA14O95837 355 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 LDHCP07864 332 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 OR52Z1P0C646 297 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 CD53P19397 219 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 CTSSP25774 331 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 TNFRSF8P28908 595 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 HALP42357 657 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 MEOX1P50221 254 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 STAT5BP51692 787 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ASIC1P78348 528 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 DSC2Q02487 901 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 LRRC63Q05C16 580 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 PPP3CAQ08209 521 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 ADAM9Q13443 819 aa4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
USP25-210ENST00000549362 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms