RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 ERMARDQ5T6L9 678 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SPRYD7Q5W111 196 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 OSCP1Q8WVF1 389 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 BTN2A2Q8WVV5 523 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SENP8Q96LD8 212 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 A8MX80 341 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GLP2RO95838 553 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 LAG3P18627 525 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 BLVRAP53004 296 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KCNA10Q16322 511 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 STX19Q8N4C7 294 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ASB7Q9H672 318 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FKBP9O95302 570 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ITGB6P18564 788 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FAM83EQ2M2I3 478 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FKBP9P1Q75LS8 142 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CPA6Q8N4T0 437 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FAM136AQ96C01 138 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 KLRG1Q96E93 195 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 WDR18Q9BV38 432 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 MRIQ9BWK5 157 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GAKO14976 1311 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF185O15231 689 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CCL16O15467 120 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SEPT4O43236 478 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 TADA3O75528 432 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 SEC23AQ15436 765 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 C11orf49Q9H6J7 331 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF556Q9HAH1 456 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 USP20Q9Y2K6 914 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRB-204ENST00000538708 GRIN1Q05586 938 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 TCEA2Q15560 299 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 RXFP2Q8WXD0 754 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 BRD9Q9H8M2 597 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 RRN3Q9NYV6 651 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 CHUKO15111 745 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 PLA2G6O60733 806 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 SLITRK3O94933 977 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 AMD1P17707 334 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 CYP2F1P24903 491 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 HDAC4P56524 1084 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 PPP2R2AP63151 447 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 MTM1Q13496 603 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FLOT2Q14254 428 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 HECTD3Q5T447 861 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FAM124AQ86V42 546 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 CERS5Q8N5B7 392 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 ABCC13Q9NSE7 274 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 AURKCQ9UQB9 309 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 TBL1XO60907 577 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 CYP2A7P20853 494 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 IL10P22301 178 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 TOMM20Q15388 145 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 POM121L1PQ3SYA9 428 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 MARC1Q5VT66 337 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRB-204ENST00000538708 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms