RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533817.5

TSTA3-216, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-216ENST00000533817 PRR33A8MZF0 331 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 MDM4O15151 490 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 MMEP08473 750 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 RALAP11233 206 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 TNK2Q07912 1038 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 FIGNQ5HY92 759 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 BTBD8Q5XKL5 378 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 TRIM68Q6AZZ1 485 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 ZNF677Q86XU0 584 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 KIAA1958Q8N8K9 716 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 WBP2Q969T9 261 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 NACA2Q9H009 215 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 MIS12Q9H081 205 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 MYO6Q9UM54 1294 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 WNT6Q9Y6F9 365 aa15.56■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 GREM1O60565 184 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 CHRNB2P17787 502 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 STARD6P59095 220 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 FMO1Q01740 532 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 CDR2Q01850 454 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 PRKCQQ04759 706 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 PDGFRLQ15198 375 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 SCUBE3Q8IX30 993 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 TTC16Q8NEE8 873 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 CEP83Q9Y592 693 aa15.55■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 E2F8A0AVK6 867 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 LRRC53A6NM62 1247 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 SART1O43290 800 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 LSM8O95777 96 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 LTFP02788 710 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 ERBB2P04626 1255 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 FYNP06241 537 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 ARSAP15289 507 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 IFNAR2P48551 515 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 NOMO3P69849 1222 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 EML3Q32P44 896 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 TPRG1Q6ZUI0 275 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 EDEM1Q92611 657 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 PDCL3Q9H2J4 239 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 EBF3Q9H4W6 596 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.54■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 IRF1P10914 325 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 GLULP15104 373 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 FERP16591 822 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 SOX9P48436 509 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 ARID5AQ03989 594 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 EFEMP1Q12805 493 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 RUNX3Q13761 415 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 MSANTD2Q6P1R3 559 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 MIB1Q86YT6 1006 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 FBXL6Q8N531 539 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 TTC8Q8TAM2 541 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 NOX5Q96PH1 765 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 NUP58Q9BVL2 599 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 MFSD1Q9H3U5 465 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 MARCH2Q9P0N8 246 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.53■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.52■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15.52■□□□□ 0.08
TSTA3-216ENST00000533817 A0A1W2PQJ5 194 aa15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms