RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532908.5

BBS1-220, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, humanhuman

TSL 5

Gene BBS1, Length 1,001 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BBS1-220ENST00000532908 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
BBS1-220ENST00000532908 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.58□□□□□ -0.08
BBS1-220ENST00000532908 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa14.58□□□□□ -0.08
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