RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530005.5

SLC43A3-217, Transcript of solute carrier family 43 member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC43A3, Length 1,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3-217ENST00000530005 DHCR24Q15392 516 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 CCDC183Q5T5S1 534 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 PMF1Q6P1K2 205 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 NELL1Q92832 810 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.34■□□□□ 0.85
SLC43A3-217ENST00000530005 OPRD1P41143 372 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 MFAP3P55082 362 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ADIGQ0VDE8 80 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF528Q3MIS6 628 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 HTR3DQ70Z44 454 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SCML4Q8N228 414 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SHC3Q92529 594 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 OTUB2Q96DC9 234 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 FAM81BQ96LP2 452 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 NACA2Q9H009 215 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ACP6Q9NPH0 428 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.33■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 M0QYV0 167 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 EGFP01133 1207 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 KRT5P13647 590 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 MRE11P49959 708 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 KCNMA1Q12791 1236 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 NR1H3Q13133 447 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ANO10Q9NW15 660 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 IRF1P10914 325 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 RALAP11233 206 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 GPD2P43304 727 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 Q6ZNB5 142 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 CD101Q93033 1021 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 E7ENQ6 273 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 STC2O76061 302 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 DRD1P21728 446 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 RGS7P49802 495 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 CCR3P51677 355 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 DAOAP59103 153 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 SATB1Q01826 763 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 STX1AQ16623 288 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 MEA1Q16626 185 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 TSSK4Q6SA08 328 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 C12orf40Q86WS4 652 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 HSFY1Q96LI6 401 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 KLKB1P03952 638 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 MESP2Q0VG99 397 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 MIB1Q86YT6 1006 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ZBTB44Q8NCP5 570 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 FANCLQ9NW38 375 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 R4GN57 208 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ADH1CP00326 375 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ADH5P11766 374 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 LCP1P13796 627 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 GNA15P30679 374 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 CXCL12P48061 93 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 TMEM25Q86YD3 366 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC43A3-217ENST00000530005 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms