RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529524.1

PSMA1-208, Transcript of proteasome subunit alpha 1, human

TSL 3

Gene PSMA1, Length 743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA1-208	ENST00000529524	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	FYB1	O15117	783 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	SNX2	O60749	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TUSC2	O75896	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CD63	P08962	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TACR3	P29371	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MAML1	Q92585	1016 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MARK4	Q96L34	752 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	AKAP10	O43572	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TULP3	O75386	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TPH1	P17752	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	YY1	P25490	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	KLRC1	P26715	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	HSF1	Q00613	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MCL1	Q07820	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	NPY5R	Q15761	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	LYZL4	Q96KX0	146 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524		B4DGG1	531 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CPT1A	P50416	773 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CFHR1	Q03591	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	INPPL1	O15357	1258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ADRA1D	P25100	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MCM5	P33992	734 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	THBS3	P49746	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CNGA2	Q16280	664 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PSMA1-208	ENST00000529524	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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