RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 NAGPAQ9UK23 515 aa25.21■■□□□ 1.63
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM24O15164 1050 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 KAT7O95251 611 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB41Q5JT25 222 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 EMC10Q5UCC4 262 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 KLHDC10Q6PID8 442 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 KBTBD6Q86V97 674 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC33Q8N5R6 958 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD52Q8NB46 1076 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 LMO3Q8TAP4 145 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 KAT5Q92993 513 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 P2RY11Q96G91 374 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 USP18Q9UMW8 372 aa25.2■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 AXIN1O15169 862 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 RPP40O75818 363 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 APBB3O95704 486 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP1R2P41236 205 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 GAD2Q05329 585 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC40Q4G0X9 1142 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 FOXR2Q6PJQ5 311 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 DLL3Q9NYJ7 618 aa25.19■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A0A0MRY4 1105 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 PMM2O15305 246 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 Q6ZNB5 142 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 BHLHA9Q7RTU4 235 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ALLCQ8N6M5 410 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 CLIC5Q9NZA1 410 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 DNMT3LQ9UJW3 386 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TSPAN16Q9UKR8 245 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 MMP17Q9ULZ9 603 aa25.18■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 DCLK1O15075 740 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TULP3O75386 442 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 APODP05090 189 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 GRIA2P42262 883 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 PDE4CQ08493 712 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ANO4Q32M45 955 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM92Q6UXU6 159 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 MIB1Q86YT6 1006 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM59Q8IWR1 403 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 IL17RCQ8NAC3 791 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TFAP2BQ92481 460 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 EBF1Q9UH73 591 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 HCN2Q9UL51 889 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 SDK1Q7Z5N4 2213 aa25.17■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 O00370 1275 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 STC2O76061 302 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 CALCAP01258 141 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 KLKB1P03952 638 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 CD19P15391 556 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TIE1P35590 1138 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 PAK1Q13153 545 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 SGO2Q562F6 1265 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF276Q8N554 614 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TSTD1Q8NFU3 115 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 UBA3Q8TBC4 463 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ULBP1Q9BZM6 244 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 BICDL2A1A5D9 508 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 SGK1O00141 431 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAM23O75077 832 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC192P0DO97 292 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 PLA2G4AP47712 749 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 PSEN1P49768 467 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TKTL1P51854 596 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 CAMK4Q16566 473 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGEF19Q8IW93 802 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC26Q8TAB7 109 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 NT5C1BQ96P26 610 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 MED15Q96RN5 788 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 SEMA4GQ9NTN9 838 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 MYOFQ9NZM1 2061 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 GABBR2O75899 941 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 RALAP11233 206 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 TNFRSF4P43489 277 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 BCAT1P54687 386 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 UBE2HP62256 183 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-204ENST00000528201 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
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