RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526040.6

RPS6KA1-212, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-212ENST00000526040 TULP2O00295 520 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 TKTL1P51854 596 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 GAD2Q05329 585 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 BST2Q10589 180 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 CLEC17AQ6ZS10 378 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGEF19Q8IW93 802 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC26Q8TAB7 109 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 UBA3Q8TBC4 463 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 PNKPQ96T60 521 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 VPS13AQ96RL7 3174 aa28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 K7EQS6 105 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 O00370 1275 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 GREM1O60565 184 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 GCNT1Q02742 428 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 C12orf40Q86WS4 652 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGAP18Q8N392 663 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 DCLK2Q8N568 766 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 TFAP2BQ92481 460 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 SPHK2Q9NRA0 654 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 DMDP11532 3685 aa28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 HRO43593 1189 aa28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 CNR2P34972 360 aa28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 PM20D1Q6GTS8 502 aa28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 SYT13Q7L8C5 426 aa28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 WDR5BQ86VZ2 330 aa28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 ULBP1Q9BZM6 244 aa28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 LRRC4Q9HBW1 653 aa28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 NCDNQ9UBB6 729 aa28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZBED1O96006 694 aa28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 PKDCCQ504Y2 493 aa28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 LCLAT1Q6UWP7 414 aa28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 TMEM25Q86YD3 366 aa28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 CAMKK1Q8N5S9 505 aa28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 USP33Q8TEY7 942 aa28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 ACDQ96AP0 544 aa28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 NUP62CLQ9H1M0 184 aa28.01■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 APODP05090 189 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 SETSIPP0DME0 302 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 SEC13P55735 322 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 CNGA2Q16280 664 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 ANO4Q32M45 955 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 BTBD8Q5XKL5 378 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 MIB1Q86YT6 1006 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 NAT16Q8N8M0 369 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 KCTD13Q8WZ19 329 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 KREMEN1Q96MU8 473 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZSWIM1Q9BR11 485 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 LMBRD1Q9NUN5 540 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 RASAL2Q9UJF2 1139 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 RAB23Q9ULC3 237 aa28■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 A0A0A0MRY4 1105 aa27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 KAT7O95251 611 aa27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 PXNP49023 591 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADIGQ0VDE8 80 aa27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 MESP2Q0VG99 397 aa27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 EFEMP1Q12805 493 aa27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 STILQ15468 1287 aa27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 C2orf27AQ580R0 203 aa27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRR23BQ6ZRT6 265 aa27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 IRF2BP1Q8IU81 584 aa27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 ARHGEF4Q9NR80 690 aa27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 ANTXRLA6NF34 631 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 STC2O76061 302 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 CALCAP01258 141 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 BRD2P25440 801 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 GRIA2P42262 883 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF132P52740 706 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 COG7P83436 770 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 KDSRQ06136 332 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 DMC1Q14565 340 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 LPAL2Q16609 132 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC35F5Q8WV83 523 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 HHIPQ96QV1 700 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1-212ENST00000526040 DPCR1Q3MIW9 517 aa27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms