RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 CFAP57Q96MR6 1250 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 RILPQ96NA2 401 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 EBF4Q9BQW3 602 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.49□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 H3BNX3 289 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 ZMPSTE24O75844 475 aa8.48□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.48□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 C2orf69Q8N8R5 385 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 SFI1A8K8P3 1242 aa8.48□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 TRIM49CP0CI26 452 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 NR4A1P22736 598 aa8.48□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.48□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 UTS2BQ765I0 119 aa8.48□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.48□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 GOLGA8TH3BQL2 631 aa8.47□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 ACADVLP49748 655 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 CDK9P50750 372 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 SLC18A1P54219 525 aa8.47□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 CBWD6Q4V339 395 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.47□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 ACAP3Q96P50 834 aa8.47□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 EHD1Q9H4M9 534 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 SOX13Q9UN79 622 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 POMPQ9Y244 141 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.47□□□□□ -1.05
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CLVS1-204ENST00000518858 FSCN2O14926 492 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 EDIL3O43854 480 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 KRT34O76011 436 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 CD247P20963 164 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 ANXA13P27216 316 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 GJC1P36383 396 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 CRKP46108 304 aa8.47□□□□□ -1.05
CLVS1-204ENST00000518858 NDST2P52849 883 aa8.47□□□□□ -1.05
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