RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514198.1

RHOBTB3-215, Transcript of Rho related BTB domain containing 3, human

TSL 5

Gene RHOBTB3, Length 496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOBTB3-215	ENST00000514198	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TBX3	O15119	743 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FRS3	O43559	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PIAS2	O75928	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	BRAF	P15056	766 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PGD	P52209	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	HSF1	Q00613	529 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CFHR3	Q02985	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SEC23B	Q15437	767 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MAML1	Q92585	1016 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198		B4DGG1	531 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198		H7C4K7	107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	EXOC5	O00471	708 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SPRY2	O43597	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	INMT	O95050	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TOMM40	O96008	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MYB	P10242	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	HTR6	P50406	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	GATM	P50440	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RHOBTB3-215	ENST00000514198		A8MVJ9	347 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SNX2	O60749	519 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TPH1	P17752	444 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ACVR2A	P27037	513 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TACR3	P29371	465 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ITGA8	P53708	1063 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CACNB3	P54284	484 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	USP19	O94966	1318 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	HGF	P14210	728 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ADRA1D	P25100	572 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CPT1A	P50416	773 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	STK3	Q13188	491 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	STIM1	Q13586	685 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CNGA2	Q16280	664 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	RAB27B	O00194	218 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RHOBTB3-215	ENST00000514198	CLIC1	O00299	241 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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