RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494570.1

KDM4C-211, Transcript of lysine demethylase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene KDM4C, Length 647 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4C-211ENST00000494570 UBA3Q8TBC4 463 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 P2RY11Q96G91 374 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 SHDQ96IW2 340 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 KCNH6Q9H252 994 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 EBF3Q9H4W6 596 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 ACP6Q9NPH0 428 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 CYLDQ9NQC7 956 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 EHD2Q9NZN4 543 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 COL4A2P08572 1712 aa8.66□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 KCNJ18B7U540 433 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 AVPP01185 164 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 CKMP06732 381 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 CHRNB1P11230 501 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF18P17022 549 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 CTHP32929 405 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 NHLH1Q02575 133 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 CETN1Q12798 172 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 RUNX3Q13761 415 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 GAS6Q14393 721 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 KCNJ12Q14500 433 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 SGO2Q562F6 1265 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 HECTD3Q5T447 861 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 PMF1Q6P1K2 205 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 GBP6Q6ZN66 633 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 YAF2Q8IY57 180 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 NDST4Q9H3R1 872 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 FANCLQ9NW38 375 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 C2orf42Q9NWW7 574 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 DACH1Q9UI36 760 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 CPQQ9Y646 472 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 GPR179Q6PRD1 2367 aa8.65□□□□□ -1.02
KDM4C-211ENST00000494570 FRYLO94915 3013 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 MAN2B1O00754 1011 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 MDM4O15151 490 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 TLR5O60602 858 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 ABL1P00519 1130 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 CD19P15391 556 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 HOXC13P31276 330 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 GPD2P43304 727 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 RPS9P46781 194 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 PLA2G4AP47712 749 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 BCAT1P54687 386 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 TYRO3Q06418 890 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 MESP2Q0VG99 397 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 PDGFRLQ15198 375 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 KRT31Q15323 416 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.64□□□□□ -1.03
KDM4C-211ENST00000494570 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms