RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493694.1

TIMMDC1-207, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TIMMDC1, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-207ENST00000493694 UBA7P41226 1012 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 PTPRNQ16849 979 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 SFR1Q86XK3 245 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 ZNF843Q8N446 348 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 PDZD8Q8NEN9 1154 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 C1orf216Q8TAB5 229 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 OVCA2Q8WZ82 227 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 KIF2CQ99661 725 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 CCSER2Q9H7U1 834 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 ITM2CQ9NQX7 267 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 RAI2Q9Y5P3 530 aa13.16□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 PTPRJQ12913 1337 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 SHROOM3Q8TF72 1996 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 GOLGA8IPA6NC78 632 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 GOLGA8JA6NMD2 632 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 METTL12A8MUP2 240 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 KCNJ18B7U540 433 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 GFRA2O00451 464 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 TNFSF14O43557 240 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 GREM1O60565 184 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 TMEM191BP0C7N4 346 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 TYRP14679 529 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 YWHAQP27348 245 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 FUT11Q495W5 492 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 HECTD3Q5T447 861 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 DCAF12L1Q5VU92 463 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 SNX30Q5VWJ9 437 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 NUP93Q8N1F7 819 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 FBXO32Q969P5 355 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 MMS19Q96T76 1030 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 TRIM9Q9C026 710 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 INTS13Q9NVM9 706 aa13.15□□□□□ -0.3
TIMMDC1-207ENST00000493694 A0A1B0GVT2 93 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 E9PAM4 449 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 CLDN5O00501 218 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 CISD3P0C7P0 127 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 IRF1P10914 325 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 HLA-EP13747 358 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 GARTP22102 1010 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 DDIT3P35638 169 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 TUBP50607 506 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 TPMTP51580 245 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 DHRS13Q6UX07 377 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 HTR3DQ70Z44 454 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 KCNK16Q96T55 309 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 CBWD1Q9BRT8 395 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 BBS2Q9BXC9 721 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 ELOVL4Q9GZR5 314 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 EXOC7Q9UPT5 735 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 STON1Q9Y6Q2 735 aa13.14□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 PLK4O00444 970 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 CASP5P51878 434 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 KIF19Q2TAC6 998 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 CCDC157Q569K6 752 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 MCTP1Q6DN14 999 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 TPGS1Q6ZTW0 290 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 DYMQ7RTS9 669 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 ACCSQ96QU6 501 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 B3GNT5Q9BYG0 378 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 SNX25Q9H3E2 840 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 PCIF1Q9H4Z3 704 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 IL37Q9NZH6 218 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 MARK1Q9P0L2 795 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 TBC1D7Q9P0N9 293 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 GMIPQ9P107 970 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 NAV2Q8IVL1 2488 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 TACC1O75410 805 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-207ENST00000493694 IGLV3-19P01714 112 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms