RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 HUS1O60921 280 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMP1P01033 207 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 UNGP13051 313 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP2C18P33260 490 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 RAP1GAPP47736 663 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GALCP54803 685 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CENPCQ03188 943 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DSC1Q08554 894 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CAMK2BQ13554 666 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ITIH4Q14624 930 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 UPP1Q16831 310 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CLLU1OSQ5K130 101 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF169Q8NCN4 708 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 APPL2Q8NEU8 664 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GDAP1Q8TB36 358 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TRPC4APQ8TEL6 797 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 HIC2Q96JB3 615 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NOX5Q96PH1 765 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MMS19Q96T76 1030 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LHX5Q9H2C1 402 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GUCA1BQ9UMX6 200 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PRELID1Q9Y255 219 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0U1RQJ8 604 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GNAZP19086 355 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NDST1P52848 882 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CDH8P55286 799 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL23P55773 120 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NOMO3P69849 1222 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DMPKQ09013 629 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SPIDRQ14159 915 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 IKBKEQ14164 716 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CNGA2Q16280 664 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 P3H1Q32P28 736 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SGO2Q562F6 1265 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NEPROQ6NW34 567 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 RFFLQ8WZ73 363 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SCLYQ96I15 445 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DSEQ9UL01 958 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMM22Q9Y584 194 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PTPRSQ13332 1948 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0J9YVX5 310 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CYB561D2O14569 222 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SPTLC1O15269 473 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MTA2O94776 668 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 POMCP01189 267 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ASLP04424 464 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP11A1P05108 521 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP1A2P05177 515 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC159P0C7I6 412 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ODC1P11926 461 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PORP16435 677 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LHX1P48742 406 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ACADVLP49748 655 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CLCNKBP51801 687 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GPC5P78333 572 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PALB2Q86YC2 1186 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ADGRF2Q8IZF7 708 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ABI1Q8IZP0 508 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM199Q8N511 208 aa7.54□□□□□ -1.2
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