RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 AP3M2P53677 418 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ZP2Q05996 745 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 GRIN2CQ14957 1233 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SLMAPQ14BN4 828 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MGARPQ8TDB4 240 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SNF8Q96H20 258 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SDCBP2Q9H190 292 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TMEM165Q9HC07 324 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PTPRHQ9HD43 1115 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CALB1P05937 261 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ALADP13716 330 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 GLULP15104 373 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CHN1P15882 459 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CREB1P16220 341 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PSMA2P25787 234 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PPM1AP35813 382 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PHKA2P46019 1235 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 LPIN1Q14693 890 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 QPCTQ16769 361 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 HHATQ5VTY9 493 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 UBR7Q8N806 425 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 C3orf20Q8ND61 904 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 VN1R2Q8NFZ6 395 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 EXD1Q8NHP7 514 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 UBA3Q8TBC4 463 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.34□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 A6NNZ2 444 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ATP2C2O75185 946 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 LAG3P18627 525 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 PROZP22891 400 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 GBP1P32455 592 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 GRIK3Q13003 919 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 IFT88Q13099 833 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 USP4Q13107 963 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 LRRC14Q15048 493 aa7.34□□□□□ -1.23
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HERC4-211ENST00000492996 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 ASIC4Q96FT7 647 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 CPXM1Q96SM3 734 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC4-211ENST00000492996 H3BRB1 525 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 COQ9O75208 318 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 GRAP2O75791 330 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CHRNA1P02708 482 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 KRT3P12035 628 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 ITIH2P19823 946 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PTK6Q13882 451 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CCNG2Q16589 344 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1841Q6NSI8 718 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TLCD1Q96CP7 247 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 WHRNQ9P202 907 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 HES2Q9Y543 173 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 M0QYV0 167 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 FAM107AO95990 144 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 RAD23BP54727 409 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC4-211ENST00000492996 AUHQ13825 339 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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