RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
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PRAME-213ENST00000492657 CYP2C9P11712 490 aa13.39□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
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PRAME-213ENST00000492657 LVRNQ6Q4G3 990 aa13.37□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.37□□□□□ -0.27
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PRAME-213ENST00000492657 CCDC110Q8TBZ0 833 aa13.37□□□□□ -0.27
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PRAME-213ENST00000492657 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
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PRAME-213ENST00000492657 PHBP35232 272 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 MSH2P43246 934 aa13.36□□□□□ -0.27
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PRAME-213ENST00000492657 BEX3Q00994 111 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 GBE1Q04446 702 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 FAM47CQ5HY64 1035 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SMYD5Q6GMV2 418 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD23Q86SG2 305 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 MAP7D3Q8IWC1 876 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 MZB1Q8WU39 189 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CFAP36Q96G28 342 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 DHRS4Q9BTZ2 278 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 SLC17A7Q9P2U7 560 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CACNG4Q9UBN1 327 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 CFAP73A6NFT4 308 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-213ENST00000492657 RRN3P2A6NIE6 340 aa13.36□□□□□ -0.27
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