RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIOS	Q9NXC5	875 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PADI3	Q9ULW8	664 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SI	P14410	1827 aa		6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC26	A0AVF1	554 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	C7orf72	A4D263	438 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LACTBL1	A8MY62	500 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266		H0YCG3	227 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPEF2	O14830	753 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAPK13	O15264	365 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	OGT	O15294	1046 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLSTN1	O94985	981 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	HPX	P02790	462 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	STAG3L1	P0CL83	205 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXCL8	P10145	99 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCF2	P10911	925 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCP1	P13796	627 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC9A1	P19634	815 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GDNF	P39905	211 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	VAMP7	P51809	220 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPHB4	P54760	987 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GYS2	P54840	703 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL23	P55773	120 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBASH3A	P57075	661 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR85	P60893	370 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPAG1	Q07617	926 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	STRN3	Q13033	797 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSMD6	Q15008	389 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB6	Q15916	424 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAN2A1	Q16706	1144 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	VWA3B	Q502W6	1294 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	XKR4	Q5GH76	650 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GJB7	Q6PEY0	223 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8N1Y9	231 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPD1L	Q8N335	351 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	KAT5	Q92993	513 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	BICD1	Q96G01	975 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOX2	Q96NM4	488 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	JMJD8	Q96S16	334 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSG101	Q99816	390 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAN	Q9H2C0	597 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDST4	Q9H3R1	872 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIX4	Q9UIU6	781 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		6.63	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	AQP7	O14520	342 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTGES	O14684	152 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLDN3	O15551	220 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRDC	O43847	1150 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF20A	O95235	890 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXCL10	P02778	98 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKAP5	P24588	427 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCLM	P48507	274 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM189B	P81408	668 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHRNE	Q04844	493 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	BFSP1	Q12934	665 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35	3e-45	■■■■■ 92.7
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLCL1	Q15111	1095 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYCP1	Q15431	976 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAB2	Q15742	525 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPC2	Q52LR7	807 aa		6.62	□□□□□ -1.35
RABGGTB-212	ENST00000491266	TM4SF20	Q53R12	229 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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