RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489853.1

SNRNP40-206, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 1,928 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-206	ENST00000489853	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CIITA	P33076	1130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ADCY8	P40145	1251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KRT76	Q01546	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CENPC	Q03188	943 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KDSR	Q06136	332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TROAP	Q12815	778 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62	2e-8	■■■■■ 28
SNRNP40-206	ENST00000489853	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GPR180	Q86V85	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	GML	Q99445	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ARMCX1	Q9P291	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TNKS	O95271	1327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MYH11	P35749	1972 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TECPR2	O15040	1411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853		A0A1W2PPM1	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CYP26A1	O43174	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	UGT1A9	O60656	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	H6PD	O95479	791 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	LDHC	P07864	332 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SERPINA6	P08185	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	PLS3	P13797	630 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CCDC130	P13994	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	UGT1A6	P19224	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	AOC1	P19801	751 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	UGT1A1	P22309	533 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	UGT1A4	P22310	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	JAK1	P23458	1154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	ADRA1D	P25100	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TTK	P33981	857 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RCVRN	P35243	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	UGT1A3	P35503	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	UGT1A5	P35504	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	MCAM	P43121	646 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	KRT6C	P48668	564 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	BMX	P51813	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	STAT2	P52630	851 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CTAG1A	P78358	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	OXA1L	Q15070	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	LRRC41	Q15345	812 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	EPHA7	Q15375	998 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TEAD4	Q15561	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	FXN	Q16595	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNRNP40-206	ENST00000489853	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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