RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIA2	P42262	883 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TNFRSF4	P43489	277 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G4A	P47712	749 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	FMO5	P49326	533 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD23B	P54727	409 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNH2	Q12809	1159 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CBWD6	Q4V339	395 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB41	Q5JT25	222 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SMTNL1	A8MU46	457 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	HR	O43593	1189 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ADORA2B	P29275	332 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ID4	P47928	161 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	FNTB	P49356	437 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CUL2	Q13617	745 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf74	Q86VG3	221 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SCML4	Q8N228	414 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DCLK2	Q8N568	766 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	USP33	Q8TEY7	942 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	GAB3	Q8WWW8	586 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	NACA2	Q9H009	215 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		18.19	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424		K7EQS6	105 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PAEP	P09466	180 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	RALA	P11233	206 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ADH5	P11766	374 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	COG7	P83436	770 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	MYL5	Q02045	173 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	LMNB2	Q03252	620 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ORC1	Q13415	861 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	STIL	Q15468	1287 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TATDN2	Q93075	761 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	MARK1	Q9P0L2	795 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	MYH10	P35580	1976 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ18	B7U540	433 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	GREM1	O60565	184 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	APBB3	O95704	486 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CAVIN2	O95810	425 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	APOD	P05090	189 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	VDR	P11473	427 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TGM1	P22735	817 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNJ12	Q14500	433 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	MAN2A1	Q16706	1144 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SGO2	Q562F6	1265 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	UBR7	Q8N806	425 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DCLK3	Q9C098	648 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	18.17	■□□□□ 0.5	1e-32	■■■■■ 782.6
HDAC10-216	ENST00000489424	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		18.17	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	SYCE3	A1L190	88 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	BECN2	A8MW95	431 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KAT7	O95251	611 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DGKE	P52429	567 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	BCAT1	P54687	386 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TPM4	P67936	248 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	GCNT1	Q02742	428 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	DMC1	Q14565	340 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	NFKBIB	Q15653	356 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF394	Q53GI3	561 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC16	Q8NEE8	873 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM81B	Q96LP2	452 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	NT5C1B	Q96P26	610 aa		18.16	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	MED15	Q96RN5	788 aa		18.16	■□□□□ 0.5

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