RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 GABRQQ9UN88 632 aa5.77□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 CYR61O00622 381 aa5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 KIAA0355O15063 1070 aa5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 ORC4O43929 436 aa5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 USP1O94782 785 aa5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 WDR47O94967 919 aa5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 FSHBP01225 129 aa5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
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CCL20-204ENST00000489160 SEC24CP53992 1094 aa5.76□□□□□ -1.49
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CCL20-204ENST00000489160 SLC9A6Q92581 669 aa5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 RSC1A1Q92681 617 aa5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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CCL20-204ENST00000489160 J3KTA2 159 aa5.75□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 FCHO1O14526 889 aa5.75□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 DHHO43323 396 aa5.75□□□□□ -1.49
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CCL20-204ENST00000489160 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 CPXCR1Q8N123 301 aa5.75□□□□□ -1.49
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CCL20-204ENST00000489160 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
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CCL20-204ENST00000489160 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.74□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.74□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 SPRY2O43597 315 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 ACTL6BO94805 426 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 NDUFB7P17568 137 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 CTGFP29279 349 aa5.73□□□□□ -1.49
CCL20-204ENST00000489160 PBX1P40424 430 aa5.73□□□□□ -1.49
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