RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487036.1

FAM208A-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member A, human

TSL 3

Gene FAM208A, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208A-208	ENST00000487036	SERPINF1	P36955	418 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SOX10	P56693	466 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	FHL1	Q13642	323 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	VWA1	Q6PCB0	445 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	LAYN	Q6UX15	382 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SNX19	Q92543	992 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036		A0A0B4J269	797 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	OR2W5	A6NFC9	320 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	AQP7P3	A6NL99	342 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	AGPS	O00116	658 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PIP5K1B	O14986	540 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	MPPED1	O15442	326 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	DHH	O43323	396 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ASNA1	O43681	348 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PEX1	O43933	1283 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	RASAL1	O95294	804 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	CBSL	P0DN79	551 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	HGF	P14210	728 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ADORA2A	P29274	412 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	CD6	P30203	668 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SLC5A2	P31639	672 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	CBS	P35520	551 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	GRIA3	P42263	894 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	RENBP	P51606	427 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SP2	Q02086	613 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	FOXO1	Q12778	655 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	TUBB3	Q13509	450 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	FHL3	Q13643	280 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PTK2B	Q14289	1009 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ETFDH	Q16134	617 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SPATA5	Q8NB90	893 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PPM1E	Q8WY54	764 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	CCT6B	Q92526	530 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	FAM227B	Q96M60	508 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	TRIM5	Q9C035	493 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	DACT1	Q9NYF0	836 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	LRFN1	Q9P244	771 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	HPSE	Q9Y251	543 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF521	Q96K83	1311 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	CCDC151	A5D8V7	595 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	YY2	O15391	372 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PROM1	O43490	865 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PDHA1	P08559	390 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PPP3CB	P16298	524 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	NPPB	P16860	134 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	HTR7	P34969	479 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PNLIPRP1	P54315	467 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	PRKAG1	P54619	331 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	FPGS	Q05932	587 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	POSTN	Q15063	836 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	FAXC	Q5TGI0	409 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAM208A-208	ENST00000487036	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81

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