RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 NUP62CLQ9H1M0 184 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 VPS16Q9H269 839 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 STEAP1Q9UHE8 339 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 HPSEQ9Y251 543 aa5.02□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 AGPSO00116 658 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 BMP15O95972 392 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 MT-ND5P03915 603 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 RBL1P28749 1068 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 SEMA5AQ13591 1074 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 P3H2Q8IVL5 708 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 METTL25Q8N6Q8 603 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 FCRL4Q96PJ5 515 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 USP29Q9HBJ7 922 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 PI4KBQ9UBF8 816 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 DKK4Q9UBT3 224 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 RHPN2P1A8MT19 583 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 PPEF2O14830 753 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 THAP12O43422 761 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 A1BGP04217 495 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 GHRHRQ02643 423 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 MFSD13AQ14CX5 517 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 RABEP1Q15276 862 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 RANBP10Q6VN20 620 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 TTC17Q96AE7 1141 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 TIFAQ96CG3 184 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 IQCDQ96DY2 449 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 ELOVL5Q9NYP7 299 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 MAFFQ9ULX9 164 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 A8MVJ9 347 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 F8W8V4 182 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 MOSPD3O75425 235 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 BCAR3O75815 825 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM225BP0DP42 221 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 ADRA1DP25100 572 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP10-11P60412 298 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 Q4G0T1 1027 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 MANEALQ5VSG8 457 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 USP49Q70CQ1 688 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF366Q8N895 744 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 E5RJQ4 531 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 CLIC1O00299 241 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 IL18RAPO95256 599 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 IGKV2-30P06310 120 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 MCM5P33992 734 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 CFHR3Q02985 330 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 DEUP1Q05D60 604 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 GALEQ14376 348 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 SHC4Q6S5L8 630 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 DGKHQ86XP1 1220 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 PHKBQ93100 1093 aa4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RABGGTB-210ENST00000485459 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms