RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HS6ST3Q8IZP7 471 aa17.12■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COPS5Q92905 334 aa17.12■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATXN3LQ9H3M9 355 aa17.12■□□□□ 0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP3A4P08684 503 aa17.12■□□□□ 0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADCK2Q7Z695 626 aa17.11■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PWWP2AQ96N64 755 aa17.11■□□□□ 0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO32Q969P5 355 aa17.1■□□□□ 0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPHX2P34913 555 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTF2A2P52657 109 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGA9Q13797 1035 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FKBP9P1Q75LS8 142 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3TC2Q8TF17 1288 aa17.1■□□□□ 0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPA3P15088 417 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNA4P22459 653 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCG1P45844 678 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARSHQ5FYA8 562 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NIPA1Q7RTP0 329 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C4orf32Q8N8J7 132 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa17.1■□□□□ 0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TGFB1I1O43294 461 aa17.09■□□□□ 0.33
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