RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 PODNQ7Z5L7 613 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CYP4X1Q8N118 509 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CEP70Q8NHQ1 597 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RIN3Q8TB24 985 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 HM13Q8TCT9 377 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 AFG1LQ8WV93 481 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TTC9Q92623 222 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DPF3Q92784 378 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 AIFM3Q96NN9 605 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PLVAPQ9BX97 442 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NUF2Q9BZD4 464 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 C12orf10Q9HB07 376 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 S100A14Q9HCY8 104 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 KCNK9Q9NPC2 374 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DIABLOQ9NR28 239 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GJB4Q9NTQ9 266 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 HACD3Q9P035 362 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DNM3Q9UQ16 869 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GDAQ9Y2T3 454 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SCINQ9Y6U3 715 aa7.45□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SNED1Q8TER0 1413 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 DOCK2Q92608 1830 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 A0A0G2JLW4 131 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 M0QX08 132 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PLD2O14939 933 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 AKAP10O43572 662 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 KATNA1O75449 491 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FAM155BO75949 473 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ATE1O95260 518 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 APOEP02649 317 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NTRK1P04629 796 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TMEM253P0C7T8 217 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ETS2P15036 469 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SLC5A2P31639 672 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GRIA2P42262 883 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NEK3P51956 506 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NAA20P61599 178 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CYP4A11Q02928 519 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PPATQ06203 517 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PTK2BQ14289 1009 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NR1D2Q14995 579 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NADK2Q4G0N4 442 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD40Q6AI12 368 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 C11orf63Q6NUN7 778 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZFP1Q6P2D0 407 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CHST3Q7LGC8 479 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CHSY1Q86X52 802 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 COLGALT2Q8IYK4 626 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ESX1Q8N693 406 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CALML6Q8TD86 181 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 APBB2Q92870 758 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 PHKBQ93100 1093 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 OSBP2Q969R2 916 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CEP95Q96GE4 821 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 C7orf26Q96N11 449 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 TM9SF2Q99805 663 aa7.44□□□□□ -1.22
PKP4-211ENST00000481115 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms