RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	TBX18	O95935	607 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	RARG	P13631	454 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MTHFR	P42898	656 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SCML4	Q8N228	414 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	EMC1	Q8N766	993 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	GOLGA1	Q92805	767 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	COG5	Q9UP83	839 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		13.74	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CAPN9	O14815	690 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NRDC	O43847	1150 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TLR5	O60602	858 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	LCA5L	O95447	670 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	FGF19	O95750	216 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	FYN	P06241	537 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NCAM1	P13591	858 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	GPC5	P78333	572 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SUSD6	Q92537	303 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC22A12	Q96S37	553 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	HSF2BP	O75031	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	KRT3	P12035	628 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	FLT3	P36888	993 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PPP3CC	P48454	512 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PSEN1	P49768	467 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	FGF13	Q92913	245 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TRIM11	Q96F44	468 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	RNF38	Q9H0F5	515 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	COCH	O43405	550 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MYBL1	P10243	752 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	RALA	P11233	206 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	RNF139	Q8WU17	664 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	MYADM	Q96S97	322 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	NUP85	Q9BW27	656 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SUMO3-206	ENST00000479153	TRIM7	Q9C029	511 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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