RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-215ENST00000468018 SLC8A3P57103 927 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 APBA1Q02410 837 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 DHCR24Q15392 516 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 VWA3BQ502W6 1294 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 GJB7Q6PEY0 223 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 UBA3Q8TBC4 463 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 SHC3Q92529 594 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 NDST4Q9H3R1 872 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 NAGPAQ9UK23 515 aa15.94■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 MDM4O15151 490 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 ZBED1O96006 694 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CALCAP01258 141 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CCR3P51677 355 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 ADIGQ0VDE8 80 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 KCNMA1Q12791 1236 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 NR1H3Q13133 447 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CDKAL1Q5VV42 579 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 PMF1Q6P1K2 205 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 Q6ZNB5 142 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CREBRFQ8IUR6 639 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CD101Q93033 1021 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 HSFY1Q96LI6 401 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 ULBP1Q9BZM6 244 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CNGB3Q9NQW8 809 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM63CQ9P1W3 806 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 DNMT3LQ9UJW3 386 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 NUDT5Q9UKK9 219 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15.93■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 A0A0A0MRY4 1105 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 KCNJ18B7U540 433 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 LILRB5O75023 590 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 EGFP01133 1207 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 RALAP11233 206 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 GPD2P43304 727 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 MFAP3P55082 362 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 SATB1Q01826 763 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 KCNJ12Q14500 433 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 FBXO43Q4G163 708 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 TADA2BQ86TJ2 420 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 TTC16Q8NEE8 873 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF606Q8WXB4 792 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 C2orf42Q9NWW7 574 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa15.92■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 PRR23AA6NEV1 266 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 K7ESF4 209 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 M0QYV0 167 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 STC2O76061 302 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 DAOAP59103 153 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 LY6G5CQ5SRR4 150 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 PKN3Q6P5Z2 889 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 TSSK4Q6SA08 328 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 C12orf40Q86WS4 652 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 PHTF2Q8N3S3 785 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 EXOC4Q96A65 974 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 NACA2Q9H009 215 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 ANO10Q9NW15 660 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 MARK1Q9P0L2 795 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.91■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 YJEFN3A6XGL0 299 aa15.9■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 E7ENQ6 273 aa15.9■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 RNF40O75150 1001 aa15.9■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 ADH1CP00326 375 aa15.9■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 KLKB1P03952 638 aa15.9■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 HOXA6P31267 233 aa15.9■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 CXCL12P48061 93 aa15.9■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.9■□□□□ 0.14
ATG4B-215ENST00000468018 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms