RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	SLC15A4	Q8N697	577 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ANKS1A	Q92625	1134 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		6.61	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	VWC2L	B2RUY7	222 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	MYO1C	O00159	1063 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	MYO1F	O00160	1098 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	TPP1	O14773	563 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	KIAA0355	O15063	1070 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	TBX3	O15119	743 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	TBC1D4	O60343	1298 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ZBED1	O96006	694 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	RHO	P08100	348 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	BMP5	P22003	454 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	VIPR2	P41587	438 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	PRR16	Q569H4	304 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	RNF220	Q5VTB9	566 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	FAM136A	Q96C01	138 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	DPH1	Q9BZG8	443 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		6.6	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	COL15A1	P39059	1388 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080		A0A087WWL8	130 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ADM5	C9JUS6	153 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	MGST3	O14880	152 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	HRG	P04196	525 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	RARRES1	P49788	294 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	CACNB3	P54284	484 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	SOX10	P56693	466 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	INHBE	P58166	350 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	LOXL3	P58215	753 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	SLC13A2	Q13183	592 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	GALE	Q14376	348 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	6.59	□□□□□ -1.35	1e-7	■□□□□ 9.9
RBM17-208	ENST00000467080	TIFA	Q96CG3	184 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	NELL2	Q99435	816 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	KLC4	Q9NSK0	619 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		6.59	□□□□□ -1.35
RBM17-208	ENST00000467080	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PPM1D	O15297	605 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	FRS3	O43559	492 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	NUDT3	O95989	172 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PDHA1	P08559	390 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MAPK10	P53779	464 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MPP5	Q8N3R9	675 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CAGE1	Q8TC20	777 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	MAML1	Q92585	1016 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	FKBP10	Q96AY3	582 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ZG16B	Q96DA0	208 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CAPNS2	Q96L46	248 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SERHL	Q9NQF3	203 aa		6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	WDR27	A2RRH5	827 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	TMEM233	B4DJY2	109 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080		H0YIN7	160 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	GOLIM4	O00461	696 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	CYP2C9	P11712	490 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	BRAF	P15056	766 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	GRIA3	P42263	894 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	FAM193A	P78312	1265 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SLC39A6	Q13433	755 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	RAB32	Q13637	225 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RBM17-208	ENST00000467080	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36

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