RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 LACTBL1A8MY62 500 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 TLL1O43897 1013 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ECEL1O95672 775 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 KRT7P08729 469 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CXCL8P10145 99 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 DARSP14868 501 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CCL23P55773 120 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 HDAC4P56524 1084 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 COPS2P61201 443 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 SPOPLQ6IQ16 392 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 MON1BQ7L1V2 547 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 COG5Q9UP83 839 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 MYH10P35580 1976 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 TSPAN1O60635 241 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 F2P00734 622 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ADH1AP07327 375 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 SLC7A5Q01650 507 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ADRM1Q16186 407 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 MGAT5BQ3V5L5 792 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CENPUQ71F23 418 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 RRN3Q9NYV6 651 aa7.96□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 FAM170AA1A519 330 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ABLIM1O14639 778 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 HAUS5O94927 633 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 DRG2P55039 364 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PLTPP55058 493 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 OXCT1P55809 520 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 EFHC2Q5JST6 749 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 SDE2Q6IQ49 451 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 TTC30AQ86WT1 665 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PALB2Q86YC2 1186 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 UBR7Q8N806 425 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CYB561D2O14569 222 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 FAM189A1O60320 539 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 KDM1AO60341 852 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 INHBAP08476 426 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 LSP1P33241 339 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ACAP1Q15027 740 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 EXD1Q8NHP7 514 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 SPG21Q9NZD8 308 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 SENP1Q9P0U3 644 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 C2CD2LO14523 706 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CRCPO75575 148 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ITGB3P05106 788 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 RRM1P23921 792 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CTNNB1P35222 781 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 SEZ6Q53EL9 994 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 JADE1Q6IE81 842 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 BCO2Q9BYV7 579 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 ZFATQ9P243 1243 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
USP54-210ENST00000466048 IPPQ9Y573 584 aa7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms