RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 CXorf38Q8TB03 319 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 GDAP1Q8TB36 358 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FAF2Q96CS3 445 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 HSFY1Q96LI6 401 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FGD4Q96M96 766 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PAFAH2Q99487 392 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SIKE1Q9BRV8 207 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CALN1Q9BXU9 219 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FAM96AQ9H5X1 160 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 NOD2Q9HC29 1040 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 BATF3Q9NR55 127 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 AKT3Q9Y243 479 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 RAD54BQ9Y620 910 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 A0A087WZ62 844 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 A6NJR5 290 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 H7C0C1 242 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 AP3B1O00203 1094 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC6O75061 913 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 NFICP08651 508 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CREB1P16220 341 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CYP3A5P20815 502 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PAX3P23760 479 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 IL1R2P27930 398 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FOXN2P32314 431 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FDFT1P37268 417 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ATP5OP48047 213 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PSEN1P49768 467 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CCNG1P51959 295 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 NDST1P52848 882 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 AIF1P55008 147 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SLC8A3P57103 927 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 GPX6P59796 221 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 KCNJ11Q14654 390 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TBCCQ15814 346 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 BBS9Q3SYG4 887 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PKDCCQ504Y2 493 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MORN1Q5T089 497 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FAM91A1Q658Y4 838 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ARMCX2Q7L311 632 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 STRADAQ7RTN6 431 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LRRC6Q86X45 466 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ARHGAP24Q8N264 748 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FITM2Q8N6M3 262 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ACMSDQ8TDX5 336 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 EBF2Q9HAK2 575 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ABCF3Q9NUQ8 709 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SRRDQ9UH36 339 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 FAM170AA1A519 330 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 H3BRB1 525 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 BIRC5O15392 142 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 B4GALT5O43286 388 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 LPXNO60711 386 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ATP2C2O75185 946 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ZBED1O96006 694 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ETS1P14921 441 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 TCF4P15884 667 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ANK1P16157 1881 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PRKCHP24723 683 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 PTPN4P29074 926 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CLCN3P51790 818 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 BCAT1P54687 386 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-208ENST00000464611 CDH8P55286 799 aa8.84□□□□□ -0.99
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