RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.53■■□□□ 1.04
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SCAF8-204ENST00000461219 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF132P52740 706 aa21.52■■□□□ 1.04
SCAF8-204ENST00000461219 APBA1Q02410 837 aa21.52■■□□□ 1.04
SCAF8-204ENST00000461219 TYRO3Q06418 890 aa21.52■■□□□ 1.04
SCAF8-204ENST00000461219 EFEMP1Q12805 493 aa21.52■■□□□ 1.04
SCAF8-204ENST00000461219 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.52■■□□□ 1.04
SCAF8-204ENST00000461219 RAB41Q5JT25 222 aa21.52■■□□□ 1.04
SCAF8-204ENST00000461219 MIIPQ5JXC2 388 aa21.52■■□□□ 1.04
SCAF8-204ENST00000461219 OTUB2Q96DC9 234 aa21.52■■□□□ 1.04
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SCAF8-204ENST00000461219 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
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SCAF8-204ENST00000461219 OSER1Q9NX31 292 aa21.52■■□□□ 1.04
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SCAF8-204ENST00000461219 CD101Q93033 1021 aa21.51■■□□□ 1.03
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SCAF8-204ENST00000461219 CCR3P51677 355 aa21.5■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 COG7P83436 770 aa21.5■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 ANO4Q32M45 955 aa21.5■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.5■■□□□ 1.03
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SCAF8-204ENST00000461219 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.48■■□□□ 1.03
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SCAF8-204ENST00000461219 DAOAP59103 153 aa21.47■■□□□ 1.03
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SCAF8-204ENST00000461219 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.47■■□□□ 1.03
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SCAF8-204ENST00000461219 HTR3DQ70Z44 454 aa21.47■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.47■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.47■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 EDEM1Q92611 657 aa21.47■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.47■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 NOX5Q96PH1 765 aa21.47■■□□□ 1.03
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.47■■□□□ 1.03
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