RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 CITO14578 2027 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF487B1APH4 448 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 LPXNO60711 386 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ZBED1O96006 694 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 INHBAP08476 426 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 LDLRAD1Q5T700 205 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 FAXCQ5TGI0 409 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 APOPT1Q96IL0 206 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 MANSC1Q9H8J5 431 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 KANSL3Q9P2N6 904 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CCNA1P78396 465 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SLC45A4Q5BKX6 768 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SPDYAQ5MJ70 313 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 LRRN4Q8WUT4 740 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 NPHS2Q9NP85 383 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 MCM8Q9UJA3 840 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 IKBKGQ9Y6K9 419 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SCN1AP35498 2009 aa16.64■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SMPD1P17405 629 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 NLRP9Q7RTR0 991 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 UNC93AQ86WB7 457 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CHSY1Q86X52 802 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 LRRC52Q8N7C0 313 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 DPEP3Q9H4B8 488 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 EBF2Q9HAK2 575 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 HESX1Q9UBX0 185 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 HAO1Q9UJM8 370 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 GJD2Q9UKL4 321 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 NUMBLQ9Y6R0 609 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 FAM155BO75949 473 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 MMP3P08254 477 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 PTPN9P43378 593 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 PARP6Q2NL67 630 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SLC26A11Q86WA9 606 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC110Q8TBZ0 833 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 NCAPGQ9BPX3 1015 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 KLC2Q9H0B6 622 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CNTN3Q9P232 1028 aa16.63■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 HCRTO43612 131 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 PYGBP11216 843 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CYP2F1P24903 491 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 L1CAMP32004 1257 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 DPYSL2Q16555 572 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 FYB2Q5VWT5 728 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 INPP5DQ92835 1189 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CFAP36Q96G28 342 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM237Q96Q45 408 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SETD4Q9NVD3 440 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 HES2Q9Y543 173 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 APRTP07741 180 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 PRKCHP24723 683 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 MAGEA3P43357 314 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM62Q0P6H9 643 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 DUSP28Q4G0W2 176 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 MCUQ8NE86 351 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 OR6B3Q8NGW1 331 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 RFWD2Q8NHY2 731 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CDHR5Q9HBB8 845 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF180Q9UJW8 692 aa16.62■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 SLC15A5A6NIM6 579 aa16.61■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 GPR32O75388 356 aa16.61■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CCND1P24385 295 aa16.61■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 RPL34P49207 117 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 OVGP1Q12889 678 aa16.61■□□□□ 0.25
SHQ1-202ENST00000444040 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms