RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 A0A0A0MRY4 1105 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 TRIM49BA6NDI0 452 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 PSMA7O14818 248 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 CETN3O15182 167 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 ZNF217O75362 1048 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SYPP08247 313 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 FAM163BP0C2L3 166 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 EPB41P11171 864 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 ADH5P11766 374 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 BDNFP23560 247 aa12.36□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF423Q2M1K9 1284 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SOWAHAQ2M3V2 549 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 WDR72Q3MJ13 1102 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 TCERG1LQ5VWI1 586 aa12.36□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 OSTM1Q86WC4 334 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa12.36□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 HMGB4Q8WW32 186 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 OVCA2Q8WZ82 227 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 C8orf48Q96LL4 319 aa12.36□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 ELOVL4Q9GZR5 314 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SNX25Q9H3E2 840 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 CTNND2Q9UQB3 1225 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 CPQQ9Y646 472 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 ATP8B3O60423 1300 aa12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 DSPP15924 2871 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 AKAP13Q12802 2813 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 E2F8A0AVK6 867 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 ZNF840PA6NDX5 716 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 OLFM2O95897 454 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 ABL1P00519 1130 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SERPINF2P08697 491 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 PDGFRBP09619 1106 aa12.35□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 WARSP23381 471 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF667Q5HYK9 610 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD40Q6AI12 368 aa12.35□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 ARMCX6Q7L4S7 300 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 TMEFF1Q8IYR6 380 aa12.35□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 SPATA20Q8TB22 786 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 TMC2Q8TDI7 906 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 CFAP97Q9P2B7 532 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 DEC1Q9P2X7 70 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SUSD2Q9UGT4 822 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 PILRBQ9UKJ0 227 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 LHX6Q9UPM6 363 aa12.35□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa12.35□□□□□ -0.43
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PRAME-210ENST00000442481 PTGER3P43115 390 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 PMS1P54277 932 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 ZNF445P59923 1031 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 TYRO3Q06418 890 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 RING1Q06587 406 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SEMA3BQ13214 749 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 SLC14A1Q13336 389 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 MAP7D1Q3KQU3 841 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1211LQ6NV74 962 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 LRSAM1Q6UWE0 723 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 PIP4P1Q86T03 277 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 NELFBQ8WX92 580 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 RLN3Q8WXF3 142 aa12.34□□□□□ -0.43
PRAME-210ENST00000442481 PCED1BQ96HM7 432 aa12.34□□□□□ -0.43
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