RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 ADH1CP00326 375 aa14.56□□□□□ -0.08
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PRAME-209ENST00000439106 KCNH2Q12809 1159 aa14.56□□□□□ -0.08
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PRAME-209ENST00000439106 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
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PRAME-209ENST00000439106 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
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PRAME-209ENST00000439106 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 HTR3DQ70Z44 454 aa14.54□□□□□ -0.08
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PRAME-209ENST00000439106 PHTF2Q8N3S3 785 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 ALLCQ8N6M5 410 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 TRIML1Q8N9V2 468 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 EXOC4Q96A65 974 aa14.54□□□□□ -0.08
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PRAME-209ENST00000439106 P2RY11Q96G91 374 aa14.54□□□□□ -0.08
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PRAME-209ENST00000439106 PNKPQ96T60 521 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 HESX1Q9UBX0 185 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 GMEB2Q9UKD1 530 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 RAB23Q9ULC3 237 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.082e-47■□□□□ 9.6
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PRAME-209ENST00000439106 PMM2O15305 246 aa14.53□□□□□ -0.08
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PRAME-209ENST00000439106 STC2O76061 302 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 APODP05090 189 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 CCDC192P0DO97 292 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 RALAP11233 206 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 VDRP11473 427 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 GJB7Q6PEY0 223 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 RMDN1Q96DB5 314 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-209ENST00000439106 OTUB2Q96DC9 234 aa14.53□□□□□ -0.08
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