RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP170P1Q96L14 293 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 U3KQA8 63 aa9.19□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RP1P56715 2156 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C2orf78A6NCI8 922 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRRT4C9JH25 899 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 K7EM74 188 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRR16Q569H4 304 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LENG9Q96B70 501 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP3K14Q99558 947 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPAS1Q99814 870 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1W2PQ27 194 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1W2PQ64 194 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1W2PQC6 194 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TLR4O00206 839 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAS7O60861 476 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C7P10643 843 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BPIP17213 487 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PFKLP17858 780 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRAPPC10P48553 1259 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSMC5P62195 406 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ENPP2Q13822 863 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEPT6Q14141 434 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM187BQ17R55 369 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALKAL1Q6UXT8 129 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASB18Q6ZVZ8 466 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APOLD1Q96LR9 279 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYRFLQ96LU7 910 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTRQ99707 1265 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SDC3O75056 442 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOL4O94818 638 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GIMD1P0DJR0 217 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLCN1P35523 988 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ART1P52961 327 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B3GNT9Q6UX72 402 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.17□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANK2Q01484 3957 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CITO14578 2027 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CALM1P0DP23 149 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CALM2P0DP24 149 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CALM3P0DP25 149 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FOSL1P15407 271 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CD82P27701 267 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRTAP10-9P60411 292 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAB11FIP2Q7L804 512 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC5A5Q92911 643 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CENPTQ96BT3 561 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SENP2Q9HC62 589 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYLDQ9NQC7 956 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPC1O15118 1278 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MSH4O15457 936 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TYMPP19971 482 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CIITAP33076 1130 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSPA4P34932 840 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms