RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MARSP56192 900 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 TNNC1P63316 161 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 USP4Q13107 963 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAK1Q13153 545 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF77Q15935 545 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 DDR2Q16832 855 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CBWD6Q4V339 395 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIM61Q5EBN2 209 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF667Q5HYK9 610 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRT39Q6A163 491 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARMCX6Q7L4S7 300 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 PGBD3Q8N328 593 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYT15Q9BQS2 421 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSPY26PQ9H489 355 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 LAMA1P25391 3075 aa11.5□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYH10P35580 1976 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 BICDL2A1A5D9 508 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 C7P10643 843 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIK3CAP42336 1068 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPP6P42658 865 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAGEA11P43364 429 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MXI1P50539 228 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDH8P55286 799 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 EML3Q32P44 896 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 LPCAT2Q7L5N7 544 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 HDDC3Q8N4P3 179 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 RIN3Q8TB24 985 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 SH3RF2Q8TEC5 729 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 SEMA4DQ92854 862 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYLPFQ96A32 169 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 RWDD2AQ9UIY3 292 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 FRYQ5TBA9 3013 aa11.49□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 PMM2O15305 246 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAP3K7O43318 606 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 STX10O60499 249 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 TADA3O75528 432 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 GABBR2O75899 941 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 NOL4O94818 638 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CFIP05156 583 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDGFRBP09619 1106 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 HDCP19113 662 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 BCKDHBP21953 392 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP2F1P24903 491 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANXA13P27216 316 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 STX17P56962 302 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 IRX4P78413 519 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 INCA1Q0VD86 236 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC33Q8N5R6 958 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MLKLQ8NB16 471 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MDGA1Q8NFP4 955 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR6B3Q8NGW1 331 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 USP33Q8TEY7 942 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 WHAMMQ8TF30 809 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCED1BQ96HM7 432 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAXDC2Q96IV6 333 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNX25Q9H3E2 840 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM30AQ9NV96 361 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 RAB20Q9NX57 234 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 LHX6Q9UPM6 363 aa11.48□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 A8MXQ7 604 aa11.47□□□□□ -0.57
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
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