RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428343.5

RFX8-201, Transcript of RFX family member 8, lacking RFX DNA binding domain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RFX8, Length 1,686 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8-201ENST00000428343 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.55□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 THAP2Q9H0W7 228 aa14.55□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ISCUQ9H1K1 167 aa14.55□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.55□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.55□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 HDCP19113 662 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 AVPR1AP37288 418 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 GALCP54803 685 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 EFEMP1Q12805 493 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 POTEHQ6S545 545 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 MIB1Q86YT6 1006 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 RNF38Q9H0F5 515 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 TASP1Q9H6P5 420 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 CDH7Q9ULB5 785 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.54□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ZNF263O14978 683 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 COCHO43405 550 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 NDUFA10O95299 355 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 KRT3P12035 628 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 FECHP22830 423 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 PSEN1P49768 467 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 AAK1Q2M2I8 961 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 DCAF6Q58WW2 860 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 DEFB106AQ8N104 65 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 EMC1Q8N766 993 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ADAM32Q8TC27 787 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 DESI2Q9BSY9 194 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 COX16Q9P0S2 106 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 FAM50BQ9Y247 325 aa14.53□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 HSF2BPO75031 334 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 FYNP06241 537 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 HMBSP08397 361 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 H2AFZP0C0S5 128 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 MAGEA1P43355 309 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 H2AFVQ71UI9 128 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 SCML4Q8N228 414 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 C3orf20Q8ND61 904 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 TRIM11Q96F44 468 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 MCEEQ96PE7 176 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 TFR2Q9UP52 801 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.52□□□□□ -0.08
RFX8-201ENST00000428343 NCANO14594 1321 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 ANKRD62A6NC57 917 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 NRDCO43847 1150 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 IRF1P10914 325 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 GPC5P78333 572 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 CCDC112Q8NEF3 446 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 JOSD2Q8TAC2 188 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 PARVAQ9NVD7 372 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 NENFQ9UMX5 172 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.52□□□□□ -0.09
RFX8-201ENST00000428343 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms