RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CBWD5Q5RIA9 395 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPR158Q5T848 1215 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCERG1LQ5VWI1 586 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LYSMD4Q5XG99 296 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HGSNATQ68CP4 663 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC27A1Q6PCB7 646 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RRAGAQ7L523 313 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPR155Q7Z3F1 870 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RASSF3Q86WH2 238 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMC8Q8IU68 726 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPD1LQ8N335 351 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MDGA1Q8NFP4 955 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LMO3Q8TAP4 145 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLEKHO2Q8TD55 490 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PARD3BQ8TEW8 1205 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACDQ96AP0 544 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CRACR2AQ9BSW2 395 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCIF1Q9H4Z3 704 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CAPN10Q9HC96 672 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GCNT4Q9P109 453 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COQ4Q9Y3A0 265 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATMQ13315 3056 aa10.13□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTPN13Q12923 2485 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PI4KAP42356 2102 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A0B4J269 797 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRIQ4A6NIV6 560 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GOLGA8CPA6NN73 597 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 B8ZZF3 427 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARHGAP33O14559 1287 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ABCB7O75027 752 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LDHAP00338 332 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERPING1P05155 500 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARSAP15289 507 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 P2RY2P41231 377 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRKCIP41743 596 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LIG4P49917 911 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 JAM2P57087 298 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTENP60484 403 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT83P78385 493 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYL7Q01449 175 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MBTD1Q05BQ5 628 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP24A1Q07973 514 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPP3CAQ08209 521 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TFDP1Q14186 410 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FBXO43Q4G163 708 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SFMBT2Q5VUG0 894 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 USP37Q86T82 979 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CBWD2Q8IUF1 395 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FMNL3Q8IVF7 1028 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C3orf58Q8NDZ4 430 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POMGNT1Q8WZA1 660 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 P2RY13Q9BPV8 354 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM83CQ9BQN1 747 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DESI2Q9BSY9 194 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEMA4CQ9C0C4 833 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATXN3LQ9H3M9 355 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FZD8Q9H461 694 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OBP2AQ9NY56 170 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYO1AQ9UBC5 1043 aa10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF233A6NK53 670 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAPPC3O43617 180 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC28A2O43868 658 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GJB3O75712 270 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RECQL4O94761 1208 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM49P0CI25 452 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM49CP0CI26 452 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARHGAP25P42331 645 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DLG4P78352 724 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CETN1Q12798 172 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC14A1Q13336 389 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMD6Q15008 389 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM187BQ17R55 369 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TPGS2Q68CL5 300 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMYD5Q6GMV2 418 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAREM2Q75VX8 874 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC33Q8N5R6 958 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RDH13Q8NBN7 331 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACRBPQ8NEB7 543 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIF18AQ8NI77 898 aa10.11□□□□□ -0.79
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OLIG1Q8TAK6 271 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms