RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398571.6

USP34-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP34, Length 11,357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-201ENST00000398571 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
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USP34-201ENST00000398571 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.59□□□□□ -1.68
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