RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384324.1

RNU6-378P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 378, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-378P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-378P-201ENST00000384324 KRT10P13645 584 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ABCB4P21439 1286 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ATICP31939 592 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 CYP2C18P33260 490 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 CCT8P50990 548 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 CLCN2P51788 898 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 KRTAP10-5P60370 271 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PMS2P11Q13670 270 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 STARD3Q14849 445 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 LY6KQ17RY6 165 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TMEM63BQ5T3F8 832 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 FAXCQ5TGI0 409 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 MANEALQ5VSG8 457 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 MRNIPQ6NTE8 343 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PGBD2Q6P3X8 592 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 C1orf228Q6PIY5 440 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 MAVSQ7Z434 540 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ZNF804AQ7Z570 1209 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TTC30AQ86WT1 665 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 R3HDM4Q96D70 268 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ZDHHC12Q96GR4 267 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 VPS50Q96JG6 964 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 FCRL4Q96PJ5 515 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 SLC25A32Q9H2D1 315 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PLCB1Q9NQ66 1216 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 DKK3Q9UBP4 350 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 STEAP1Q9UHE8 339 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 SNX14Q9Y5W7 946 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 LINC00473A8K010 186 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 EXOC5O00471 708 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PODXLO00592 558 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 CES2O00748 559 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 FFAR2O15552 330 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PLA2G6O60733 806 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PEX14O75381 377 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 HGFP14210 728 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 GKP32189 559 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PPM1AP35813 382 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 HSPA7P48741 367 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 SP2Q02086 613 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 KCNAB1Q14722 419 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 CLCA4Q14CN2 919 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 MAPKAPK3Q16644 382 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ST3GAL2Q16842 350 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 MPEG1Q2M385 716 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 SLC35G1Q2M3R5 365 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 C4orf46Q504U0 113 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PCID2Q5JVF3 399 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TSTD2Q5T7W7 516 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 CEP85Q6P2H3 762 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 CRTC1Q6UUV9 634 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 Q6ZWC4 215 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 SLC29A4Q7RTT9 530 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ZNF527Q8NB42 609 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 CYP2W1Q8TAV3 490 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TBC1D5Q92609 795 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 KIAA1191Q96A73 305 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 GRAMD1AQ96CP6 724 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TMEM41AQ96HV5 264 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 UROC1Q96N76 676 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TIMP4Q99727 224 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PCDHAC1Q9H158 963 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 NECTIN3Q9NQS3 549 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 SNX15Q9NRS6 342 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 DUSP22Q9NRW4 184 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 GJB4Q9NTQ9 266 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 RGL1Q9NZL6 768 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 FNIP2Q9P278 1114 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 MGAT4CQ9UBM8 478 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 CA14Q9ULX7 337 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 FAM234BA2RU67 622 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 A8MVJ9 347 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 F5H423 210 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 AP4M1O00189 453 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TMPRSS11DO60235 418 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 PMPCBO75439 489 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 JTBO76095 146 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-378P-201ENST00000384324 TJP3O95049 919 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms