RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 CUTAO60888 179 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TOMM70O94826 608 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT1P04264 644 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HK1P19367 917 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 NPY2RP49146 381 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GSDMDP57764 484 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP8B2P98198 1209 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 NSMFQ6X4W1 530 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 SULF1Q8IWU6 871 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 RELTQ969Z4 430 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TAMM41Q96BW9 452 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 EDEM2Q9BV94 578 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAM19Q9H013 955 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 POLE3Q9NRF9 147 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 NBPF26B4DH59 902 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PRSS44E7EML9 344 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PITPNM1O00562 1244 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 DCLK1O15075 740 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP3A5P20815 502 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TTMPQ5BVD1 217 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT79Q5XKE5 535 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 LYPD8Q6UX82 237 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PALM2Q8IXS6 379 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TIGARQ9NQ88 270 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ESYT3A0FGR9 886 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 FPGTO14772 594 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ATG13O75143 517 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ALX3O95076 343 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPNS1P04632 268 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KRT16P08779 473 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 BAG6P46379 1132 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HARS2P49590 506 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 AIF1P55008 147 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CHRNDQ07001 517 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ATF7IP2Q5U623 682 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP20A1Q6UW02 462 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM139Q8IV31 216 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP93Q8N1F7 819 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR156Q8NFN8 814 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 SNX19Q92543 992 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 DYDC2Q96IM9 177 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 WRNIP1Q96S55 665 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TRIM15Q9C019 465 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 LHX5Q9H2C1 402 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 C4BP0C0L5 1744 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 BTN3A1O00481 513 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 RBBP9O75884 186 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CRTAMO95727 393 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ITGB3P05106 788 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CALB1P05937 261 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 ASGR1P07306 291 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 COX5BP10606 129 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HLA-FP30511 346 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 RYKP34925 604 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 TKTL1P51854 596 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNJ10P78508 379 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP2A13Q16696 494 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 DACT2Q5SW24 774 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR73Q6P4I2 378 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-202ENST00000380828 STX12Q86Y82 276 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms