RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373193.7

PTPRT-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRT, Length 12,681 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-205ENST00000373193 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 A0A1W2PQC6 194 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ZBTB5O15062 677 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PTGS2P35354 604 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 LRPAP1P30533 357 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 RCVRNP35243 200 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 RALGDSQ12967 914 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ACOX2Q99424 681 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 LIFRP42702 1097 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 TMEM132DQ14C87 1099 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 SPATA33Q96N06 139 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 APOL2Q9BQE5 337 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PTGER2P43116 358 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 AP1S2P56377 157 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 BST2Q10589 180 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 BMPR2Q13873 1038 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 TAF13Q15543 124 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 HTRA1Q92743 480 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 CLEC4AQ9UMR7 237 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ITGB6P18564 788 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ZNF605Q86T29 641 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 KPNA6O60684 536 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 HLA-DQA2P01906 255 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 YY1P25490 414 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ITGA1P56199 1179 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 TMEM62Q0P6H9 643 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 C12orf4Q9NQ89 552 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 COPRSQ9NQ92 184 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 SPAG6O75602 509 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 MTFR1Q15390 333 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 SH3D21A4FU49 640 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ZNF879B4DU55 563 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 NCK1P16333 377 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ORC1Q13415 861 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 FAR1Q8WVX9 515 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 APBA3O96018 575 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 GRK4P32298 578 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 IL17REQ8NFR9 667 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 FAM167AQ96KS9 214 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PPCSQ9HAB8 311 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 VEPH1Q14D04 833 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 TMC2Q8TDI7 906 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 GIPC3Q8TF64 312 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 SLITRK2Q9H156 845 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 VPS26AO75436 327 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PRLP01236 227 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 SLC1A6P48664 564 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PIGKQ92643 395 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PAFAH2Q99487 392 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ALDH1A2O94788 518 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 SLC2A4P14672 509 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 ACLYP53396 1101 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 OR7A2PQ8NGA2 310 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PHF21BQ96EK2 531 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PSMD14O00487 310 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 CHN2P52757 468 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 CCDC185Q8N715 623 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 BDH2Q9BUT1 245 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 IL12AP29459 219 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 GSTM5P46439 218 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 NR6A1Q15406 480 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-205ENST00000373193 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms