RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 CDH6P55285 790 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SKP1P63208 163 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 AKAP14Q86UN6 197 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 STX12Q86Y82 276 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 URGCPQ8TCY9 931 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PI4KBQ9UBF8 816 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CLTCL1P53675 1640 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 NRKQ7Z2Y5 1582 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MATN2O00339 956 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CHRNDQ07001 517 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 BROXQ5VW32 411 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GZMAP12544 262 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PAX3P23760 479 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PEX3P56589 373 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PUDPQ08623 228 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 DPYSQ14117 519 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF618Q5T7W0 954 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RFT1Q96AA3 541 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX13BQ9BXU2 312 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 IL1RL2Q9HB29 575 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 IRAK3Q9Y616 596 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LOC100653049A0A140TA62 436 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 HOXC6P09630 235 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP2C9P11712 490 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RCVRNP35243 200 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CYB5R4Q7L1T6 521 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 DEPDC4Q8N2C3 294 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 OR7A2PQ8NGA2 310 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 REPS1Q96D71 796 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 BLMHQ13867 455 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PADI6Q6TGC4 694 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM179Q6ZVK1 233 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 C11orf70Q9BRQ4 267 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFS3O75489 264 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TSHRP16473 764 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TPI1P60174 286 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC45A4Q5BKX6 768 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC30A5Q8TAD4 765 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CHP2O43745 196 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 UQCRBP14927 111 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 NR2C2P49116 596 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ACCSLQ4AC99 568 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ERMARDQ5T6L9 678 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 OR6Y1Q8NGX8 325 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MTMR12Q9C0I1 747 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 BARHL2Q9NY43 387 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PRELID1Q9Y255 219 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 AK5Q9Y6K8 562 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM92AA1XBS5 289 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 Q3C1V9 767 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 HES6Q96HZ4 224 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RACGAP1Q9H0H5 632 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TASP1Q9H6P5 420 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 HPS4Q9NQG7 708 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PFDN2Q9UHV9 154 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 V9GYQ6 96 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PEX1O43933 1283 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RAG1P15918 1043 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RPL3P39023 403 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CASP4P49662 377 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF394Q53GI3 561 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1841Q6NSI8 718 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 OR6P1Q8NGX9 317 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FICDQ9BVA6 458 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 DDHD2O94830 711 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SERPINB5P36952 375 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PRIM2P49643 509 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ARPP19P56211 112 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LGALS3BPQ08380 585 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKAA1Q13131 559 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TFDP3Q5H9I0 405 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GJD3Q8N144 294 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.93□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 METP08581 1390 aa10.93□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 DFFAO00273 331 aa10.93□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 BNIP3LO60238 219 aa10.93□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 E2F8A0AVK6 867 aa10.93□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 EXTL3O43909 919 aa10.93□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM153BP0C7A2 387 aa10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms