RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000333175.9

TMEM259-201, Transcript of transmembrane protein 259, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM259, Length 2,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259-201ENST00000333175 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM259-201ENST00000333175 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM259-201ENST00000333175 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.96■■□□□ 1.27
TMEM259-201ENST00000333175 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 PDK2Q15119 407 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SNCBQ16143 134 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 TEX264Q9Y6I9 313 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 CYP2F1P24903 491 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 BNIP1Q12981 228 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 PTPN18Q99952 460 aa22.95■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 PTK7Q13308 1070 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 CCDC185Q8N715 623 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 FAAP100Q0VG06 881 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 FBXO41Q8TF61 875 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SERAC1Q96JX3 654 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 CYTH2Q99418 400 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 PPCSQ9HAB8 311 aa22.94■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 RASA2Q15283 850 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 PYROXD2Q8N2H3 581 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.264e-10■■■■■ 53.2
TMEM259-201ENST00000333175 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 PAK5Q9P286 719 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 DERAQ9Y315 318 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 EDF1O60869 148 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 TGM2P21980 687 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 TEKT4Q8WW24 435 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 CNTN3Q9P232 1028 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 CPA4Q9UI42 421 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.93■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 CHADO15335 359 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 TREHO43280 583 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 L1CAMP32004 1257 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 RNF43Q68DV7 783 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 KLHL29Q96CT2 875 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 COX16Q9P0S2 106 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 GLTPD2A6NH11 291 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 KPNA7A9QM74 516 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 MGRN1O60291 552 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 MT-ND3P03897 115 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SETSIPP0DME0 302 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SLC18A1P54219 525 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 OVGP1Q12889 678 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 OTOAQ7RTW8 1153 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 BANPQ8N9N5 519 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 ERP27Q96DN0 273 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 AP4E1Q9UPM8 1137 aa22.92■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 BRCA2P51587 3418 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 ZWINTO95229 277 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 INHBAP08476 426 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 NQO1P15559 274 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 BEX3Q00994 111 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 PPM1NQ8N819 430 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 TBCBQ99426 244 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 ZNF670Q9BS34 389 aa22.91■■□□□ 1.26
TMEM259-201ENST00000333175 SNX25Q9H3E2 840 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms