RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 TADA1Q96BN2 335 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 RMND5AQ9H871 391 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 CAAP1Q9H8G2 361 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 F9P00740 461 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH2P05091 517 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 PTGISQ16647 500 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 RD3Q7Z3Z2 195 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 LPCAT1Q8NF37 534 aa23.06■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 MED8Q96G25 268 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC40Q9H9A6 602 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 CRTAMO95727 393 aa23.06■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.05■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V1B1P15313 513 aa23.05■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 ADGRE3Q9BY15 652 aa23.04■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF682O95780 498 aa23.04■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 STX5Q13190 355 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 ACOX2Q99424 681 aa23.04■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 SNX8Q9Y5X2 465 aa23.04■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 H3BRB1 525 aa23.03■■□□□ 1.28
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PTPRM-201ENST00000332175 GMCL1Q96IK5 515 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 KRT84Q9NSB2 600 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 POU6F1Q14863 301 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PTPRM-201ENST00000332175 HPGDP15428 266 aa23.03■■□□□ 1.28
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